23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2869 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.61 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  36.12 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.48 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.88 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  33.33 
 
 		 322 aa  96.3  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.12 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.39 
 
 		 361 aa  75.5  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.7 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  30.07 
 
 		 165 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.37 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  28.67 
 
 		 163 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.24 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  29.41 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  30.88 
 
 		 168 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  27.07 
 
 		 168 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.16 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  30.6 
 
 		 173 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  27.61 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  27.46 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  32.84 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.53 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.639191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>