20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1368 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1368  transmembrane domain-containing protein  100 
 
 		 850 aa  1748    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.509572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2085  G8 domain-containing protein  38.15 
 
 		 920 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.304912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2950  hypothetical protein  43.27 
 
 		 994 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2605  hypothetical protein  39.03 
 
 		 982 aa  344  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.715518  normal  0.847276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  44.59 
 
 		 458 aa  233  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27441  predicted protein  32.63 
 
 		 3191 aa  218  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  30.25 
 
 		 1110 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47839  predicted protein  26.49 
 
 		 922 aa  184  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759183  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  31.94 
 
 		 1245 aa  177  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  31.35 
 
 		 1245 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42685  predicted protein  31.07 
 
 		 847 aa  173  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0260166  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  29.92 
 
 		 1009 aa  171  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3452  hypothetical protein  28.57 
 
 		 710 aa  153  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1758  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1320 aa  127  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0717  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1457 aa  126  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0836  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1436 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3141  hypothetical protein  37.8 
 
 		 525 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  26.05 
 
 		 1502 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  27.87 
 
 		 1394 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  36.25 
 
 		 525 aa  44.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>