179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1712 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
309 aa  621  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  69.77 
 
 
303 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  64.63 
 
 
335 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  63.95 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  63.95 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  54.03 
 
 
311 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  48.66 
 
 
314 aa  316  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  48.81 
 
 
313 aa  312  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  35.23 
 
 
384 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  34.62 
 
 
374 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  36.19 
 
 
376 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  33.81 
 
 
377 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  29.93 
 
 
401 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  31.67 
 
 
404 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  29.58 
 
 
401 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  32.67 
 
 
400 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  30.85 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  31.47 
 
 
404 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  31.52 
 
 
400 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  31.58 
 
 
400 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  30.96 
 
 
405 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  30.6 
 
 
406 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  30.6 
 
 
406 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  30.77 
 
 
401 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  29.29 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  29.64 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  27.92 
 
 
395 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4218  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.73 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208016  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0125  flagellar motor switch protein FliM, putative  26.86 
 
 
316 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.626103  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  27.34 
 
 
335 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  27.34 
 
 
335 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  29.45 
 
 
332 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  29.45 
 
 
332 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  29.45 
 
 
332 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  29.45 
 
 
332 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  27.84 
 
 
334 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  29.09 
 
 
332 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  29.09 
 
 
332 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  29.09 
 
 
332 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  26.6 
 
 
335 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  26.37 
 
 
335 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  26.79 
 
 
332 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  25.54 
 
 
338 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  28.26 
 
 
332 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  28.26 
 
 
332 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1149  flagellar motor switch protein FliM  22.41 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  28.36 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  27.47 
 
 
326 aa  96.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  28.36 
 
 
332 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  25.09 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  28 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  28 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  28 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  26.45 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  27.9 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  26.45 
 
 
332 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  25.85 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  23.42 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  23.83 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  25.11 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  23.05 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  23.05 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  27.37 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  27.96 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  24.15 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  24.91 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  26.88 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  27.54 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  25.62 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  24.16 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  23.38 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  23.69 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  24.55 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  24.55 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  24.19 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  24.55 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  21.61 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  22.68 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  24.19 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2536  flagellar motor switch protein FliM  26.09 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  21.72 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  21.58 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  21.56 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  23.47 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  22.68 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  21.56 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  27.05 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  27.05 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  21.67 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  21.67 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  23.27 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  24.15 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>