45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0300 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  45.83 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  39.2 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  35.16 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  36.72 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  34.38 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  33.59 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  33.59 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  32.06 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  30.83 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  31.25 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  31.25 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  29.69 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  32.03 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  28.24 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  32.81 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.87 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.87 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.38 
 
 		 67 aa  44.3  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.67 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  34.38 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  34.38 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  34.38 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  44.9 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.67 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  28 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  46 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>