54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4277 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4277  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  100 
 
 		 139 aa  276  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.692368  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3893  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  98.56 
 
 		 139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3601  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  97.84 
 
 		 139 aa  269  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6039  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  63.24 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7245  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  64.39 
 
 		 137 aa  173  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1966  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  47.58 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0458  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  62.5 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1831  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  44 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.405977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0217  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  41.91 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3245  succinate dehydrogenase subunit D  46.4 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3691  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  45.24 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0071  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  44.44 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1903  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  44 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3979  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  45.24 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705456  normal  0.476216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4136  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  43.65 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0952  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  43.2 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.676521  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2958  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  42.86 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0326  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  41.13 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3617  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  43.55 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2799  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  42.86 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0480  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  42.06 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.74591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0229  succinate dehydrogenase subunit D  45.53 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0481798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1333  succinate dehydrogenase subunit D  40.8 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1311  succinate dehydrogenase subunit D  41.13 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0693068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2750  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  37.21 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0089  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  34.68 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2847  succinate dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1434  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  42.97 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3031  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  40.83 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0045  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  40.65 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1745  succinate dehydrogenase subunit D  36.07 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0379  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor subunit  40.98 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3564  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  34.15 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0343  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  41.6 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00603  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  38.52 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1549  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  33.06 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.591464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1536  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  37.1 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1203  succinate dehydrogenase subunit D  33.59 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.767553  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5819  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  31.67 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5889  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  34.75 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3020  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  35.34 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0568  putative succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  30.89 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0825505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1880  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.67 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2108  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  30.17 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0810  succinate dehydrogenase subunit D  33.06 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4839  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  35.88 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2866  hypothetical protein  30.83 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2635  putative succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  30 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0975  succinate dehydrogenase subunit D  30 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0087  hypothetical protein  29.17 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3526  succinate dehydrogenase subunit D  35 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1562  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  27.06 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.725991  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0591  succinate dehydrogenase membrane anchor subunit  27.06 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.141224  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1222  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  27.78 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>