52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3691 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3691  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  100 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3979  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  96.83 
 
 		 126 aa  246  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705456  normal  0.476216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4136  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  76.98 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2958  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  74.6 
 
 		 126 aa  204  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1831  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  68 
 
 		 131 aa  173  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.405977  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1903  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  68 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0952  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  64.8 
 
 		 131 aa  168  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.676521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3245  succinate dehydrogenase subunit D  60 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1966  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  52.42 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192092 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0089  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  50 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3601  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  46.03 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4277  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  45.24 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.692368  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3893  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  46.03 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6039  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  46.72 
 
 		 137 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7245  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  44.26 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396127  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3617  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  47.54 
 
 		 133 aa  116  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610127  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1333  succinate dehydrogenase subunit D  44.35 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2799  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  46.72 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0326  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  45.45 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0217  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  45.08 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0071  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  43.44 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0229  succinate dehydrogenase subunit D  46.28 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0481798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1311  succinate dehydrogenase subunit D  44.44 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0693068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0480  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  44.26 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.74591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3031  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  45.16 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1434  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  47.15 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2750  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  41.94 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00603  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  43.8 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0458  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  49.49 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0379  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor subunit  44.17 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2108  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  43.55 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2847  succinate dehydrogenase subunit D  41.73 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0343  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  43.33 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1549  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  37.4 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.591464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1203  succinate dehydrogenase subunit D  42.97 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.767553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1536  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  43.8 
 
 		 128 aa  87.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1745  succinate dehydrogenase subunit D  37.3 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3564  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  39.5 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5819  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  37.7 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2866  hypothetical protein  38.21 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0045  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  37.8 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1880  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  36.89 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519683  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5889  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  39.34 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0810  succinate dehydrogenase subunit D  35.34 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4839  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  35.77 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3020  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  40.23 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0087  hypothetical protein  32.77 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2635  putative succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  32.77 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0568  putative succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  32.99 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0825505 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0975  succinate dehydrogenase subunit D  32.77 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3526  succinate dehydrogenase subunit D  31.48 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1222  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  29.55 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>