66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1880 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1880  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  100 
 
 		 125 aa  243  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2108  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  48.8 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1549  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  44 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.591464  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1831  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  40.98 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.405977  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1903  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  40.98 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0952  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  39.34 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.676521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1203  succinate dehydrogenase subunit D  45.16 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.767553  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0045  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  45.6 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1333  succinate dehydrogenase subunit D  40.16 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2958  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  38.52 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3979  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  37.7 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705456  normal  0.476216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3691  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  36.89 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3245  succinate dehydrogenase subunit D  35.2 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4136  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  34.43 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00603  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  48.35 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1311  succinate dehydrogenase subunit D  36.67 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0693068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3031  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  42.24 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3617  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  34.96 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1966  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  40.8 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192092 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0379  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor subunit  39.17 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1536  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  45.26 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0326  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  33.33 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2799  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  34.15 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7245  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  34.95 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396127  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0343  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  38.33 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6039  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  29.03 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1745  succinate dehydrogenase subunit D  33.33 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0217  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  31.4 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0071  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.52 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2750  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  36.89 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0229  succinate dehydrogenase subunit D  38.84 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0481798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3020  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  42.24 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1434  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  37.7 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0089  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  30.58 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0480  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  34.71 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.74591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4839  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  33.61 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4277  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  32.67 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.692368  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3601  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  32.67 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3893  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  32.67 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2847  succinate dehydrogenase subunit D  32.69 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0458  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  35.05 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1222  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  32.29 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0917  putative succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  34.21 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2866  hypothetical protein  33.01 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5819  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  27.05 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3564  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  29.09 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5889  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  27.05 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0568  putative succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  28.42 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0825505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0810  succinate dehydrogenase subunit D  27.55 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0190  succinate dehydrogenase subunit D  32.99 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2794  succinate dehydrogenase subunit D  32.67 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.104306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0087  hypothetical protein  29.41 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2635  putative succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  29.41 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2324  succinate dehydrogenase subunit D  25.26 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1214  succinate dehydrogenase subunit D  33.7 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0975  succinate dehydrogenase subunit D  29.41 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3601  succinate dehydrogenase subunit D  28.32 
 
 		 121 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2284  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  29.59 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0262  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor  32.69 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2151  succinate dehydrogenase subunit D  29.59 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2894  succinate dehydrogenase subunit D  27.55 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4432  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  29.59 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4362  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  29.7 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3935  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  29.59 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2705  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  30.97 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0561791 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3593  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  29.59 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>