23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3897 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3897  TadE family protein  100 
 
 		 176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  84.09 
 
 		 202 aa  287  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  84.09 
 
 		 202 aa  286  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  47.43 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0541  TadE family protein  41.14 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  30.53 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  35.83 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  32.97 
 
 		 223 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  30.81 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  28.67 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  28.26 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  29.85 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  23.71 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  26.2 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  25.97 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  30.38 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  24.19 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  24.29 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  25.68 
 
 		 242 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  26.76 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  25.56 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2272  hypothetical protein  26.7 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.953892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  32.47 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>