38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1505 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  100 
 
 		 330 aa  658    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  94.85 
 
 		 330 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  94.85 
 
 		 330 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  67.3 
 
 		 327 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  67.3 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  69.25 
 
 		 323 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  67.61 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  72.99 
 
 		 325 aa  427  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  72.99 
 
 		 325 aa  427  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  65.93 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  67.08 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  68.65 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  66.15 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  64.58 
 
 		 325 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  65.76 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  56.78 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  56.44 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  60.25 
 
 		 323 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  60.25 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  59.32 
 
 		 323 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  57.76 
 
 		 323 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  58.39 
 
 		 323 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  53.94 
 
 		 318 aa  331  9e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.21 
 
 		 323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  55.21 
 
 		 319 aa  318  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  54.35 
 
 		 323 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  56.15 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.09 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  64.29 
 
 		 267 aa  241  9e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  63.31 
 
 		 178 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.17 
 
 		 175 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  56.38 
 
 		 172 aa  165  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  56.63 
 
 		 174 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.72 
 
 		 163 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  30 
 
 		 175 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  30.67 
 
 		 174 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  30.67 
 
 		 174 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>