29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2679 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 		 351 aa  704    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  64.1 
 
 		 351 aa  456  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  57.83 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  55.97 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  57.43 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  42.9 
 
 		 370 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  39.04 
 
 		 375 aa  266  5e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  36.39 
 
 		 371 aa  235  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  36.05 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  36.52 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  38 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  36.75 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  35.55 
 
 		 349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  35.83 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  35.03 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  34.41 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  28.66 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  23.5 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  23.7 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  23.5 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  23.5 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  23.12 
 
 		 383 aa  85.9  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.29 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  27.33 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.08 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.19 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  24.09 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  23.33 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1107  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.7 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>