More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2386 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2386  30S ribosomal protein S11P  100 
 
 		 131 aa  263  5.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0421655  normal  0.64544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2900  30S ribosomal protein S11P  86.18 
 
 		 131 aa  222  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2223  30S ribosomal protein S11P  84.43 
 
 		 132 aa  217  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1245  30S ribosomal protein S11P  81.3 
 
 		 131 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000186566  normal  0.971043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1802  30S ribosomal protein S11P  87.07 
 
 		 129 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1620  30S ribosomal protein S11P  72 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.677477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0076  30S ribosomal protein S11P  75.21 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0038  30S ribosomal protein S11P  75.83 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0422  ribosomal protein S11P  66.41 
 
 		 129 aa  179  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2552  ribosomal protein S11P  65.62 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2522  30S ribosomal protein S11P  63.93 
 
 		 128 aa  173  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132893  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2591  30S ribosomal protein S11P  66.39 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.50824  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1818  30S ribosomal protein S11P  64.46 
 
 		 129 aa  165  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1398  ribosomal protein S11P  64.12 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.708751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1099  30S ribosomal protein S11P  63.11 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1352  30S ribosomal protein S11P  61.02 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0272  30S ribosomal protein S11P  61.02 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0566  30S ribosomal protein S11P  61.02 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.549434 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0632  30S ribosomal protein S11P  60.17 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1053  ribosomal protein S11P  61.98 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0618466  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1813  30S ribosomal protein S11P  59.06 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0540  30S ribosomal protein S11P  59.06 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0132624 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1623  30S ribosomal protein S11P  60 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50886  predicted protein  61.74 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1654  30S ribosomal protein S11P  59.06 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29967  Ribosomal protein S14, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  58.93 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51773  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87510  40S ribosomal protein S14-B (RP59B)  59.82 
 
 		 136 aa  141  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464079  normal  0.172566 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05960  40S ribosomal protein S14 (Broad)  60.71 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1645  30S ribosomal protein S11P  60.34 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100802 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00670  structural constituent of ribosome, putative  59.66 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.39165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2146  30S ribosomal protein S11P  61.16 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000001001  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1450  30S ribosomal protein S11  63.54 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0257  30S ribosomal protein S11P  55.75 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  46.22 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  46.22 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  46.67 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  45.83 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  45.83 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  45 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  45 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  45 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  45 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  45 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  45 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 131 aa  87  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 129 aa  87  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  36.89 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575404  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  37.82 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0778  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04498  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>