More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2079 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  50.79 
 
 
757 aa  750    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  51.11 
 
 
760 aa  750    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  50.81 
 
 
799 aa  760    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  72.85 
 
 
762 aa  1120    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  50.38 
 
 
785 aa  748    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  50.59 
 
 
758 aa  749    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  66.36 
 
 
758 aa  1038    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  71.94 
 
 
762 aa  1112    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  51.84 
 
 
788 aa  764    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  51.45 
 
 
769 aa  762    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  52.42 
 
 
785 aa  774    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
761 aa  1559    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  51.86 
 
 
780 aa  772    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  50.2 
 
 
758 aa  752    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  59.42 
 
 
754 aa  883    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  50.86 
 
 
758 aa  752    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  74.31 
 
 
761 aa  1152    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  42.48 
 
 
758 aa  587  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  44.29 
 
 
781 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  42.35 
 
 
758 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  42.22 
 
 
758 aa  582  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  42.27 
 
 
782 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  42.78 
 
 
824 aa  552  1e-155  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  41.41 
 
 
794 aa  529  1e-149  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  40.8 
 
 
779 aa  515  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  41.58 
 
 
809 aa  513  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  39.04 
 
 
765 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  40.77 
 
 
810 aa  496  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  39.74 
 
 
764 aa  495  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  39.82 
 
 
812 aa  490  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.61 
 
 
810 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  40.28 
 
 
809 aa  488  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  38.12 
 
 
825 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  37.62 
 
 
798 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  37.37 
 
 
795 aa  458  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  38.16 
 
 
760 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  37.8 
 
 
791 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  36.7 
 
 
837 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  37.42 
 
 
791 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  37.68 
 
 
791 aa  446  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  37.67 
 
 
819 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  36.9 
 
 
821 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  38.5 
 
 
795 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  37.42 
 
 
791 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  37.55 
 
 
791 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  36.86 
 
 
790 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  37.1 
 
 
795 aa  443  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  37.93 
 
 
790 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  37.42 
 
 
791 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  37.55 
 
 
792 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  37.37 
 
 
791 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 
790 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 
793 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  37.42 
 
 
801 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  37.12 
 
 
796 aa  438  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  36.16 
 
 
839 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  36.94 
 
 
800 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  37.26 
 
 
806 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  36.16 
 
 
839 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  37.42 
 
 
791 aa  439  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  37.28 
 
 
801 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 
803 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 
800 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 
800 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  36.71 
 
 
838 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
799 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  37.06 
 
 
800 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  37.33 
 
 
801 aa  435  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 
800 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  36.92 
 
 
798 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 
800 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 
799 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  35.99 
 
 
792 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  37.12 
 
 
796 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
799 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
799 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  37.63 
 
 
797 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  36.21 
 
 
794 aa  432  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  38.11 
 
 
791 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  36.19 
 
 
793 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  37.3 
 
 
792 aa  432  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
799 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
812 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  36.88 
 
 
806 aa  430  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  36.21 
 
 
794 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  36.43 
 
 
810 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 
799 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
799 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  37.21 
 
 
806 aa  430  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
799 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 
799 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
799 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  36.89 
 
 
801 aa  432  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  36.95 
 
 
796 aa  429  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  36.98 
 
 
794 aa  428  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  36.43 
 
 
790 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  36.95 
 
 
796 aa  429  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  36.95 
 
 
799 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  34.84 
 
 
832 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  36.59 
 
 
792 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>