More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1934 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1934  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 140 aa  291  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1859  thioredoxin  39.52 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.263827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0815  thioredoxin-related  37.5 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221245  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  37.21 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  35.92 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  33.66 
 
 		 259 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  37.89 
 
 		 259 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  33.98 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  37.36 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  38.64 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  33.71 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  33.01 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  34 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  31.07 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  33.01 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  37.21 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  35.35 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  36.78 
 
 		 700 aa  72.4  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  31.78 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  34.31 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  33.65 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  33.98 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  33.65 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  37.25 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  32.35 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  28.71 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  36.36 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  34.31 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  34.31 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  34.09 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  36.63 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  32.67 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  35.96 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  33.01 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  32.69 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  32.32 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  33.33 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  27.62 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  33.02 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  29.46 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  32.08 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  33.01 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  30.1 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  30.19 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  32.35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  32.69 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  33.02 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  32.35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  31.13 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  29.13 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  30.63 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  31.19 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  30.39 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  31.13 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  35 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  32.08 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  35 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  31.82 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  31.07 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  31.07 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  31.07 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  32.69 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  31.37 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.37 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  35.96 
 
 		 257 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  33 
 
 		 107 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  30.1 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  34.34 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  29 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  29.13 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  32.35 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  25.22 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  28.43 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  32.35 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  27.72 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  31.07 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  31.13 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  31.68 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  30.39 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>