More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8114 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  100 
 
 		 419 aa  865    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  68.09 
 
 		 421 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  71.68 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  72.35 
 
 		 430 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  72.35 
 
 		 430 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  71.06 
 
 		 447 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  71.83 
 
 		 430 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  68.69 
 
 		 432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  67.17 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  67.17 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  67.17 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  67.17 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  67.17 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  67.42 
 
 		 432 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  67.17 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  67.17 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  67.17 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.92 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  63.33 
 
 		 461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.08 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  62.35 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  66.75 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.75 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  65.34 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  66.75 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  66.75 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.75 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65.03 
 
 		 461 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  52.05 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  54.74 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  52.76 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  53.23 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  52.37 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  51.3 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.79 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  50.79 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  52.73 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.09 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.2 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.24 
 
 		 447 aa  349  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.73 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  46.88 
 
 		 391 aa  332  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  42.82 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  43.56 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  42.62 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.49 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  42.49 
 
 		 432 aa  315  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  42.55 
 
 		 439 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.32 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.76 
 
 		 448 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.68 
 
 		 474 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  41.43 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.92 
 
 		 530 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.75 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.08 
 
 		 432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  42.08 
 
 		 432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  42.08 
 
 		 432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.43 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.94 
 
 		 447 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.24 
 
 		 454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.32 
 
 		 537 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  41.44 
 
 		 469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  43.19 
 
 		 434 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  41.98 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.18 
 
 		 447 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  42.53 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  44.78 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.09 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  41.92 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 669 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.13 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.32 
 
 		 440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.2 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.92 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.75 
 
 		 417 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  41.39 
 
 		 419 aa  302  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.99 
 
 		 531 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4418  cytochrome c, class I  41.37 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3948  cytochrome c, class I  41.37 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.49 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.95 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.49 
 
 		 538 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.45 
 
 		 415 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  40.61 
 
 		 447 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.56 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  39.66 
 
 		 434 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  39.51 
 
 		 476 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.32 
 
 		 419 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  41.33 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  43.91 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  43.91 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.03 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.74 
 
 		 531 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.25 
 
 		 531 aa  295  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  40.72 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  40.68 
 
 		 675 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.78 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.18 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>