26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7034 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  100 
 
 		 140 aa  287  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  29.27 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  31.82 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  33.05 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  35.85 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  34.17 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  32.26 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  30.36 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  26.02 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  33.04 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  30.28 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  33.33 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  31.2 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  33.33 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  29.52 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  32.28 
 
 		 309 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  29.51 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  29.01 
 
 		 317 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  27.27 
 
 		 310 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  29.2 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  30.53 
 
 		 312 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.51 
 
 		 316 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  27.62 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>