67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6617 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6617  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 382 aa  789    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1535  monooxygenase, FAD-binding  47.04 
 
 		 398 aa  352  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5587  monooxygenase FAD-binding  48.85 
 
 		 398 aa  348  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0585344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5077  hypothetical protein  44.44 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192036  normal  0.166404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5388  monooxygenase FAD-binding  36.08 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0142  hypothetical protein  28.42 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1352  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1353  hypothetical protein  47.87 
 
 		 97 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.506771  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1354  hypothetical protein  55.07 
 
 		 108 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.353424  normal  0.227575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0685  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.23 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00002921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0585  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.23 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2983  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.78 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000743082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0825  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.31 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  21.73 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0692  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.93 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000811141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0709  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.78 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00621  hypothetical protein  23.78 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00630  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.78 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000612482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2964  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  23.78 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000940784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.48 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0777  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.8 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000759163  normal  0.821116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0536  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4- benzoquinone hydroxylase UbiF  22.49 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0730  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.16 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0789  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.16 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1820  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.09 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00177812  hitchhiker  0.00000000175067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5199  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.47 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0716  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.16 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000335906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1109  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.94 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.666485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5106  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.2 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  21.28 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01232  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.6 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  22.57 
 
 		 419 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5259  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.43 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  22.74 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02229  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.69 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  23.17 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2914  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  28.04 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000488899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1827  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  21.62 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2537  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  22.63 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3004  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  28.04 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000162425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1828  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  28.04 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  21.88 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  26.17 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1640  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  22.29 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571236  normal  0.32038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  26.07 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5024  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.11 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004210  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.85 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000272017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0817  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.2 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0219172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5257  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.32 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1071  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.71 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0719385  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.65 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  22.6 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  22.52 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  38.18 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  25.08 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3756  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  43.33 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.27687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3133  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.1 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.113474  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 413 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1198  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.13 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1156  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.92 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3304  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  20.75 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0850508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0026  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.47 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  22.19 
 
 		 408 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47320  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.93 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  23.05 
 
 		 460 aa  43.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  35 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5197  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.02 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>