59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0142 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0142  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  776    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5388  monooxygenase FAD-binding  32.5 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5077  hypothetical protein  32.12 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192036  normal  0.166404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6617  monooxygenase FAD-binding  28.42 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1535  monooxygenase, FAD-binding  30.64 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5587  monooxygenase FAD-binding  31.35 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0585344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1352  hypothetical protein  32.26 
 
 		 157 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0442  hypothetical protein  22.01 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0681  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  20.23 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0215428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  25.75 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2789  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.12 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3596  hypothetical protein  23.85 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1353  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.506771  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0539  hypothetical protein  22.06 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  29.63 
 
 		 475 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2897  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  22.89 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0358307  normal  0.859236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  23.31 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  23.31 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_002978  WD0177  monoxygenase family protein  22.32 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  23.31 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0384  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  27.33 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2051  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  21.67 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0991465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4587  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.24 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2055  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  23.81 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  24.21 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3477  hypothetical protein  22.01 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3664  ubiquinone biosynthesis hydroxylase family protein  25.74 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1198  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.85 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3065  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  20.68 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0203848  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  33.75 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3622  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  21.39 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 404 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25 
 
 		 552 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0079  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.88 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0535408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  22.71 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0088  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231112  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  26.55 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1308  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  21.78 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329179  hitchhiker  0.00458676 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.55 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  23.7 
 
 		 547 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  23.81 
 
 		 489 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3133  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.4 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.113474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0267  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  23.22 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192574  normal  0.370598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  24.54 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3904  kynurenine 3-monooxygenase  23.44 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  26.37 
 
 		 564 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03549  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  23.04 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0298  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  23.13 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  25.47 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  29.76 
 
 		 431 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 561 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03536  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00140)  39.66 
 
 		 643 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0981  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.14 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0886227  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0026  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.55 
 
 		 418 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11089  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11650)  26.04 
 
 		 624 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00144907  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  25.61 
 
 		 475 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0163  2-polyprenyl-6-methoxyphenol 4-hydroxylase  19.74 
 
 		 410 aa  42.7  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0453  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  22.38 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00796447  normal  0.115301 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57166  phenol 2-monooxygenase  39.66 
 
 		 724 aa  42.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.368445  normal  0.635098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>