44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6405 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6405    100 
 
 		 450 bp  892    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    90.32 
 
 		 753 bp  539  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  89.75 
 
 		 753 bp  513  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  89.08 
 
 		 753 bp  460  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    87.93 
 
 		 753 bp  450  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  87.47 
 
 		 753 bp  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  87.73 
 
 		 753 bp  444  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    87.47 
 
 		 752 bp  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  88.05 
 
 		 753 bp  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  86.49 
 
 		 741 bp  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  86.91 
 
 		 753 bp  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  86.82 
 
 		 753 bp  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    87.74 
 
 		 503 bp  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  86.9 
 
 		 753 bp  410  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    86.68 
 
 		 699 bp  410  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    87.23 
 
 		 753 bp  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  88.65 
 
 		 1041 bp  400  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    88.19 
 
 		 972 bp  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.14 
 
 		 960 bp  381  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    86.02 
 
 		 752 bp  363  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    85.61 
 
 		 754 bp  357  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  89.19 
 
 		 705 bp  333  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  88.58 
 
 		 684 bp  311  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    84.63 
 
 		 522 bp  303  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    83.9 
 
 		 754 bp  291  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    86.45 
 
 		 337 bp  289  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  83.83 
 
 		 753 bp  281  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    85.34 
 
 		 716 bp  252  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    81.69 
 
 		 456 bp  220  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  90.27 
 
 		 753 bp  137  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  90.27 
 
 		 753 bp  137  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    85.44 
 
 		 189 bp  131  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    82.8 
 
 		 466 bp  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    82.52 
 
 		 391 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    85.06 
 
 		 243 bp  69.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    84.88 
 
 		 105 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1884    88.33 
 
 		 168 bp  63.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  85.92 
 
 		 1041 bp  61.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    82.18 
 
 		 635 bp  58  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    94.12 
 
 		 748 bp  52  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    84.85 
 
 		 195 bp  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  96.55 
 
 		 780 bp  50.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    93.75 
 
 		 703 bp  48.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    93.55 
 
 		 201 bp  46.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>