22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4469 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4469  hypothetical protein  100 
 
 		 669 aa  1208    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4535  hypothetical protein  69.86 
 
 		 699 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  44.77 
 
 		 768 aa  234  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0748  hypothetical protein  44.56 
 
 		 762 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  44.38 
 
 		 776 aa  207  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2071  hypothetical protein  39.75 
 
 		 728 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0802327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  31.05 
 
 		 478 aa  94  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  32.37 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  30.84 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  36.31 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  27.57 
 
 		 452 aa  57.4  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  26.54 
 
 		 458 aa  55.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  30.14 
 
 		 446 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  26.54 
 
 		 458 aa  54.7  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  32.43 
 
 		 416 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0468  hypothetical protein  34.46 
 
 		 479 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  28.94 
 
 		 428 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  34.53 
 
 		 313 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  33.15 
 
 		 476 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.93 
 
 		 734 aa  47.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  28.8 
 
 		 496 aa  47  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1189  hypothetical protein  25.5 
 
 		 444 aa  45.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.826438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>