146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3220 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3220  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.36 
 
 
336 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.36 
 
 
336 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.36 
 
 
336 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.36 
 
 
336 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.36 
 
 
336 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.36 
 
 
336 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.36 
 
 
336 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  30.91 
 
 
376 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  30.91 
 
 
365 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
355 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  33.68 
 
 
345 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
355 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1410  transposase  31.08 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176947  normal  0.221999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0231  hypothetical protein  45.28 
 
 
280 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
355 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  28.43 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  34.74 
 
 
345 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  34.74 
 
 
345 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  29.79 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  29.79 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  29.79 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  29.79 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  29.79 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01089  hypothetical protein  36.96 
 
 
342 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02022  hypothetical protein  35.87 
 
 
342 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02463  hypothetical protein  36.96 
 
 
342 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02605  hypothetical protein  36.96 
 
 
343 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06388  hypothetical protein  36.96 
 
 
342 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  29.79 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05897  hypothetical protein  36.96 
 
 
258 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2345  transposase  30.28 
 
 
280 aa  47.4  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0117  IS630 family transposase  26.14 
 
 
207 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4112  IS630 family transposase  26.14 
 
 
207 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02548  hypothetical protein  35.87 
 
 
342 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05080  hypothetical protein  35.87 
 
 
342 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05893  hypothetical protein  35.87 
 
 
342 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06044  hypothetical protein  35.87 
 
 
342 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2860  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1633  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.889999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1621  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1617  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207058  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1064  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2037  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1912  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  29.41 
 
 
351 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1737  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00237927  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0926  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2449  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1478  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1059  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1492  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2787  hypothetical protein  36.84 
 
 
387 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0683  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0348  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00547365  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0277  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0802  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0748  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0917  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0808  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  32.14 
 
 
345 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0456  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0463  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1378  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1425  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1463  transposase  32.18 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106674  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  31.58 
 
 
379 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0007  hypothetical protein  31.52 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0394  transposase  32.18 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.238933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3167  IS630 family transposase  30 
 
 
206 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4437  IS630 family transposase  30 
 
 
206 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1308  transposase  32.18 
 
 
117 aa  45.1  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.426794  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  31.15 
 
 
172 aa  44.3  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  27.36 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0442  hypothetical protein  40.62 
 
 
387 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0992939  normal  0.042563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0629  hypothetical protein  40.62 
 
 
387 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3487  hypothetical protein  40.62 
 
 
387 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3880  hypothetical protein  40.62 
 
 
387 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  26.42 
 
 
353 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  29.79 
 
 
343 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  29.03 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  29.03 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  29.03 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  29.03 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  29.03 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  29.03 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  29.03 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  29.03 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  29.03 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1138  hypothetical protein  30.77 
 
 
342 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1412  hypothetical protein  30.77 
 
 
342 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1933  hypothetical protein  30.77 
 
 
342 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1965  hypothetical protein  30.77 
 
 
342 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2869  hypothetical protein  30.77 
 
 
351 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  25.49 
 
 
351 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  31.25 
 
 
346 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2891  hypothetical protein  38.81 
 
 
197 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.20151  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0126  hypothetical protein  42.86 
 
 
387 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1805  hypothetical protein  41.18 
 
 
387 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0375  transposase and inactivated derivatives-like protein  28.24 
 
 
332 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>