More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2860 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0277  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1617  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207058  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0683  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0463  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53403  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0802  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1378  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1621  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1492  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1425  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1463  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1478  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0348  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00547365  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1633  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.889999  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0917  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0808  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1059  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0926  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1064  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2037  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0748  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1737  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00237927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1912  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2449  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2860  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0394  transposase  99.47 
 
 
188 aa  390  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.238933  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0456  transposase  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1308  transposase  99.15 
 
 
117 aa  243  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.426794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0375  transposase and inactivated derivatives-like protein  35.75 
 
 
332 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4534  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.75 
 
 
332 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1997  transposase  35.75 
 
 
332 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4459  transposase  35.75 
 
 
332 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0643  transposase  35.75 
 
 
332 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0713  hypothetical protein  36.16 
 
 
331 aa  89.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1977  hypothetical protein  36.16 
 
 
331 aa  89.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2017  hypothetical protein  36.16 
 
 
331 aa  89.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.943461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3798  hypothetical protein  30.16 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2014  hypothetical protein  35.03 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0567677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2369  putative transposase  30.64 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000809874  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  29.53 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  29.53 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  29.53 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0241  transposase  27.11 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000404674  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1338  hypothetical protein  29.03 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3598  hypothetical protein  34.48 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289609  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  26.92 
 
 
355 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  26.75 
 
 
350 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  26.92 
 
 
355 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  26.92 
 
 
355 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.38 
 
 
336 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.38 
 
 
336 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.38 
 
 
336 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.38 
 
 
336 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.38 
 
 
336 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.38 
 
 
336 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.38 
 
 
336 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  26.58 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2701  putative transposase  25.9 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.15 
 
 
350 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.08 
 
 
349 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.2 
 
 
345 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02463  hypothetical protein  28.17 
 
 
342 aa  58.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.41 
 
 
350 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01089  hypothetical protein  30.71 
 
 
342 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06388  hypothetical protein  28.17 
 
 
342 aa  57.8  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0801  hypothetical protein  27.92 
 
 
342 aa  57.8  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1138  hypothetical protein  27.92 
 
 
342 aa  57.8  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1412  hypothetical protein  27.92 
 
 
342 aa  57.8  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1933  hypothetical protein  27.92 
 
 
342 aa  57.8  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1965  hypothetical protein  27.92 
 
 
342 aa  57.8  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02022  hypothetical protein  28.17 
 
 
342 aa  57.8  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2869  hypothetical protein  27.92 
 
 
351 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05080  hypothetical protein  28.17 
 
 
342 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  26.87 
 
 
348 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  26.87 
 
 
348 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  26.87 
 
 
348 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05893  hypothetical protein  28.17 
 
 
342 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4601  hypothetical protein  36.73 
 
 
103 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805525  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.68 
 
 
350 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02548  hypothetical protein  28.17 
 
 
342 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02605  hypothetical protein  31.21 
 
 
343 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06044  hypothetical protein  28.17 
 
 
342 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05897  hypothetical protein  28.32 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.68 
 
 
350 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.68 
 
 
350 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.68 
 
 
350 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  21.34 
 
 
352 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  21.34 
 
 
352 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.68 
 
 
350 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.68 
 
 
350 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  28.36 
 
 
348 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  27.1 
 
 
207 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2345  transposase  28.19 
 
 
280 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.68 
 
 
350 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.68 
 
 
350 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  21.34 
 
 
352 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  21.34 
 
 
352 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  21.34 
 
 
352 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  21.34 
 
 
352 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  21.34 
 
 
352 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  21.34 
 
 
352 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>