More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1876 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1876  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0387  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  88.66 
 
 
194 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.576972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  75 
 
 
192 aa  298  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.24 
 
 
212 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6969  hypothetical protein  56.4 
 
 
219 aa  187  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.64 
 
 
240 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.13 
 
 
160 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.48 
 
 
200 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686516  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0619  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.19 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4932  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.54 
 
 
227 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3870  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  62.79 
 
 
257 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0939038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.2 
 
 
217 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.67 
 
 
226 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1273  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.7 
 
 
193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.93 
 
 
224 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.3 
 
 
307 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.404178  normal  0.998145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.56 
 
 
199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.46 
 
 
229 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0360  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.02 
 
 
266 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0302  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.91 
 
 
305 aa  164  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.833959  normal  0.0865771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0346  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.91 
 
 
305 aa  164  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590288  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.15 
 
 
196 aa  164  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.740038  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1682  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.8 
 
 
264 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1269  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.88 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090481  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.29 
 
 
264 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.6 
 
 
210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.420797  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.12 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.74 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.333261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.47 
 
 
258 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.57 
 
 
223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1783  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.8 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1167  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.16 
 
 
224 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.71 
 
 
206 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3017  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.99 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4701  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.6 
 
 
255 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493501  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.41 
 
 
206 aa  161  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3879  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.04 
 
 
205 aa  160  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0055  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.69 
 
 
241 aa  160  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2829  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.68 
 
 
419 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  0.0616505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.31 
 
 
225 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.31 
 
 
225 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4672  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.08 
 
 
201 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.497967  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.29 
 
 
259 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5811  hypothetical protein  50.64 
 
 
223 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.36 
 
 
224 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0902  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.37 
 
 
286 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.3 
 
 
354 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.098708  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.99 
 
 
187 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0540206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2647  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.83 
 
 
248 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  0.288591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6213  hypothetical protein  51.97 
 
 
231 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0050  putative lipoprotein  50.31 
 
 
241 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2873  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.83 
 
 
222 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716515  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0049  putative lipoprotein  50.31 
 
 
241 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5015  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 
226 aa  158  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2129  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.57 
 
 
408 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838619  normal  0.0574467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4381  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.54 
 
 
197 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
243 aa  158  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.63 
 
 
232 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1053  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.81 
 
 
195 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.39 
 
 
187 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0706  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG domain-containing protein  45.99 
 
 
197 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0943  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.83 
 
 
204 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4122  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.33 
 
 
263 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.4 
 
 
249 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6995  hypothetical protein  52.03 
 
 
247 aa  157  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.78 
 
 
209 aa  157  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.644821  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1965  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.29 
 
 
233 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2770  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.26 
 
 
224 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36007  normal  0.0902261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.22 
 
 
190 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0061  hypothetical protein  51.22 
 
 
232 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.3 
 
 
267 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2851  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.5 
 
 
214 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.67 
 
 
263 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2488  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.07 
 
 
371 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.048272  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  43.62 
 
 
206 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1841  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.71 
 
 
263 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.96 
 
 
215 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.33235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1371  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.65 
 
 
250 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0761  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.3 
 
 
249 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.17 
 
 
247 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3518  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.21 
 
 
195 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.886237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6654  hypothetical protein  57.04 
 
 
190 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.59 
 
 
239 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239202  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.48 
 
 
249 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4131  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.4 
 
 
421 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0500  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.22 
 
 
230 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  44.75 
 
 
206 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.85 
 
 
274 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1336  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.3 
 
 
262 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3653  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.2 
 
 
199 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0501  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.9 
 
 
249 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.35 
 
 
269 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831337  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1675  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.61 
 
 
259 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.55 
 
 
255 aa  154  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2570  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.14 
 
 
283 aa  154  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1564  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.4 
 
 
197 aa  154  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195162  normal  0.304052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1092  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.35 
 
 
204 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4451  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.19 
 
 
214 aa  154  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0398  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.16 
 
 
246 aa  154  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.177632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3329  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.2 
 
 
199 aa  154  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>