27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0128 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  62.36 
 
 
307 aa  321  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  62.93 
 
 
299 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  44.06 
 
 
310 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  42.32 
 
 
333 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  42.42 
 
 
303 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  41.3 
 
 
333 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  42.54 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  42.38 
 
 
339 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  40.53 
 
 
372 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  35.23 
 
 
322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  31.29 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  30.94 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  30.07 
 
 
333 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  26.59 
 
 
220 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  24.34 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  27.98 
 
 
304 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  26.9 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  26.9 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  23.57 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  23.57 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  23.57 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  24.74 
 
 
307 aa  52.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  22.11 
 
 
321 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  24.51 
 
 
278 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0710  hypothetical protein  32.61 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.03339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>