More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1457 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  100 
 
 		 421 aa  874    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  33.17 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 		 560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  30.65 
 
 		 572 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  29.87 
 
 		 551 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  27.08 
 
 		 546 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  26.2 
 
 		 537 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  27.68 
 
 		 534 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  27.8 
 
 		 533 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  27.46 
 
 		 533 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  26.48 
 
 		 549 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 549 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  24.92 
 
 		 535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  28.2 
 
 		 538 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  24.51 
 
 		 535 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  24.51 
 
 		 535 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  24.51 
 
 		 535 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  25.62 
 
 		 546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  25 
 
 		 547 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  28.67 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  27.76 
 
 		 535 aa  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  29.33 
 
 		 561 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  27.07 
 
 		 540 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  27.24 
 
 		 577 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  27.3 
 
 		 587 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  22.15 
 
 		 540 aa  90.1  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  26.37 
 
 		 555 aa  87.4  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  21.68 
 
 		 553 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 132 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  28.57 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  28.57 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  28.57 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  28.57 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  28.57 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  28.57 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  28.57 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  27.27 
 
 		 133 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 131 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  26.52 
 
 		 148 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  29.85 
 
 		 134 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0315  putative response regulator  22.82 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  22.33 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 131 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 131 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 953 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  27.61 
 
 		 131 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 131 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 129 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  27.34 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.91 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00781234  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  30.71 
 
 		 137 aa  66.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 128 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 129 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  23.41 
 
 		 539 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  29.6 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  31.88 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 129 aa  65.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  32.28 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  25.42 
 
 		 129 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 		 131 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  24.37 
 
 		 139 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  26.05 
 
 		 129 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 129 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 127 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  28.81 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  21.54 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01904  CheY-like receiver protein  22.22 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.466885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  26.89 
 
 		 130 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  26.05 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  26.89 
 
 		 130 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 123 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 123 aa  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  26.89 
 
 		 122 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>