37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4804 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  100 
 
 		 262 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  100 
 
 		 262 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  94.35 
 
 		 262 aa  354  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  67.42 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  65.73 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  64.82 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  45.45 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  45.21 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  36.11 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  40 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  38.69 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  28.89 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  29.37 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  40.46 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  32.7 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  35.35 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  34.18 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  28.88 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  36.79 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  23.83 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  36.36 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  32.52 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  30.39 
 
 		 448 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 320 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  29.94 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  36.9 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  25.33 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  30.56 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  26.77 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  25.73 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  30.51 
 
 		 314 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  24.36 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>