More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2761 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2761  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.680423  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2063  histone family protein DNA-binding protein  95.6 
 
 		 91 aa  179  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0888639  normal  0.0279949 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2910  histone family protein DNA-binding protein  84.62 
 
 		 91 aa  160  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.351014  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1244  histone family protein DNA-binding protein  84.62 
 
 		 91 aa  158  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.50556  normal  0.20479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  49.45 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  47.73 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  43.96 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  45.65 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  45.05 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1431  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0064808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1080  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0899853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0988  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.165109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1095  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.939272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1047  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.788464 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1015  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  43.96 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00916  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2731  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00160452  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  42.86 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1073  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2684  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193078  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00923  hypothetical protein  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.294308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1018  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000522422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1009  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000570398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2208  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000105854  normal  0.266842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2416  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000431379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2236  integration host factor subunit beta  46.74 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00572513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1380  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0262  integration host factor beta-subunit  43.96 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  41.76 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2395  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000343473  unclonable  0.00000762549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  41.76 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  41.76 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2067  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000478736  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  45.05 
 
 		 93 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  41.76 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000837765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  44.44 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0957  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00640345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  45.05 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1931  integration host factor, beta subunit  43.96 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  44.57 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  42.86 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  42.86 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3026  hypothetical protein  45.05 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2884  hypothetical protein  45.05 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  43.96 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2338  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2312  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000159711  hitchhiker  0.000000300932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>