13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2428 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2428  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  929    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  30.83 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  33.11 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  22.6 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  21.6 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  22.22 
 
 		 454 aa  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  21.4 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  20.9 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  23.99 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  21.23 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>