More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1770 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  60.11 
 
 		 543 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  59.28 
 
 		 538 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  59.09 
 
 		 538 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  58.59 
 
 		 534 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  59.28 
 
 		 538 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  61.71 
 
 		 525 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  59.28 
 
 		 538 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  62.45 
 
 		 534 aa  648    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  61.94 
 
 		 532 aa  644    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  59.05 
 
 		 535 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  60.87 
 
 		 542 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  59.66 
 
 		 538 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 539 aa  1121    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  58.48 
 
 		 538 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  57.91 
 
 		 534 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  59.2 
 
 		 539 aa  628  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  60.78 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  58.1 
 
 		 534 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  60.87 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  59.92 
 
 		 541 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  60.35 
 
 		 528 aa  624  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  58.67 
 
 		 537 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  58.72 
 
 		 536 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  58.67 
 
 		 537 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  56.49 
 
 		 550 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  58.67 
 
 		 537 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1097  L-aspartate oxidase  58.27 
 
 		 531 aa  620  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.565133  normal  0.0527143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  58.6 
 
 		 538 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  58.6 
 
 		 538 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  58.81 
 
 		 536 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  58.48 
 
 		 537 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  58.29 
 
 		 537 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  58.29 
 
 		 537 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  58.67 
 
 		 538 aa  618  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  58.86 
 
 		 537 aa  621  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  58.67 
 
 		 537 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  59.42 
 
 		 541 aa  615  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  58.03 
 
 		 539 aa  617  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  58.86 
 
 		 537 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  58.93 
 
 		 537 aa  617  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  56.23 
 
 		 541 aa  615  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  60.31 
 
 		 532 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  58.24 
 
 		 535 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  59.45 
 
 		 542 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  57.82 
 
 		 536 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  59.14 
 
 		 528 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  57.59 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  58.83 
 
 		 533 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  54.06 
 
 		 531 aa  608  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  58.27 
 
 		 534 aa  610  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  55.26 
 
 		 531 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  58.45 
 
 		 533 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  56.33 
 
 		 533 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  58.45 
 
 		 533 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  58.95 
 
 		 528 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  55.89 
 
 		 531 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  59.34 
 
 		 528 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  58.95 
 
 		 528 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  57.63 
 
 		 537 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  58.95 
 
 		 528 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  56.33 
 
 		 545 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  56.36 
 
 		 533 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  56.36 
 
 		 545 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  59.14 
 
 		 532 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  58.08 
 
 		 540 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  56.36 
 
 		 533 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  58.95 
 
 		 528 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  59.14 
 
 		 532 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  58.95 
 
 		 528 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  57.92 
 
 		 540 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  57.92 
 
 		 540 aa  601  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  58.45 
 
 		 570 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  55.71 
 
 		 531 aa  598  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  57.92 
 
 		 540 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  58.45 
 
 		 535 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  58.98 
 
 		 523 aa  599  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  58.45 
 
 		 533 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  58.45 
 
 		 570 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  58.45 
 
 		 570 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  56.14 
 
 		 533 aa  601  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  58.45 
 
 		 570 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  58.45 
 
 		 570 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  55.79 
 
 		 534 aa  601  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  57.92 
 
 		 540 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  57.83 
 
 		 540 aa  598  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  56.12 
 
 		 533 aa  596  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  58.25 
 
 		 533 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  55.53 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  57.83 
 
 		 530 aa  598  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  56.15 
 
 		 538 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  57.53 
 
 		 540 aa  596  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  56.76 
 
 		 540 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  56.37 
 
 		 532 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  54.17 
 
 		 532 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  57.14 
 
 		 540 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  56.95 
 
 		 540 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  58.91 
 
 		 529 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  57.14 
 
 		 539 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  56.76 
 
 		 539 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  53.32 
 
 		 543 aa  594  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>