41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1530 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 300 aa  622  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  51.28 
 
 		 164 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  41.51 
 
 		 159 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  35.67 
 
 		 217 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  30.38 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  27.21 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  25.95 
 
 		 168 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.45 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  25.81 
 
 		 152 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  26.9 
 
 		 172 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  25.32 
 
 		 168 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  28.45 
 
 		 160 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  23.42 
 
 		 168 aa  52.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  27.27 
 
 		 166 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  28.18 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  28.77 
 
 		 158 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  25.48 
 
 		 169 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  25.48 
 
 		 169 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  26.09 
 
 		 154 aa  49.3  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  24.56 
 
 		 155 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  24.35 
 
 		 154 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.48 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30.28 
 
 		 166 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  24.8 
 
 		 155 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  26.09 
 
 		 124 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  27.27 
 
 		 154 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  24.35 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  23.91 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  25 
 
 		 169 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  29.03 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  25.76 
 
 		 158 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  30.59 
 
 		 184 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  23.48 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  23.48 
 
 		 154 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  23.48 
 
 		 154 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  23.48 
 
 		 154 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  23.48 
 
 		 154 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  21.66 
 
 		 171 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  23.23 
 
 		 204 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  29.29 
 
 		 137 aa  42.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>