44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0999 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0947  L-seryl-tRNA selenium transferase  91.53 
 
 		 354 aa  661    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0999  L-seryl-tRNA selenium transferase  100 
 
 		 354 aa  721    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1682  L-seryl-tRNA selenium transferase  91.24 
 
 		 354 aa  660    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1219  L-seryl-tRNA selenium transferase  68.47 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.587199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1169  L-seryl-tRNA selenium transferase  63.61 
 
 		 354 aa  463  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1320  Selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  25.49 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603065  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  30.28 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  33.07 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  25.82 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  25.82 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  34.34 
 
 		 472 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27.65 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2965  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  28.21 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  25.62 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  30.93 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5303  selenocysteine synthase  26.92 
 
 		 425 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5215  selenocysteine synthase  26.92 
 
 		 425 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  23.38 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  33.67 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5595  selenocysteine synthase  31.91 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11390  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  32.35 
 
 		 508 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.308467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  29.13 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25310  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  34.04 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.362155 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  32.97 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  31.68 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  26.23 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  30.3 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  30.3 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  30.3 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  30.3 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  30.3 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  30.3 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  33.73 
 
 		 475 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  25.79 
 
 		 475 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  24.63 
 
 		 489 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  38.6 
 
 		 476 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  26.87 
 
 		 506 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  38.6 
 
 		 476 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0439  selenocysteine synthase  32 
 
 		 535 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  38.6 
 
 		 476 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  30.43 
 
 		 480 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  35.58 
 
 		 468 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  31.52 
 
 		 495 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3738  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  60.61 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241783  normal  0.0172698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>