More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0583 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  94.41 
 
 		 555 aa  1092    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  93.51 
 
 		 555 aa  1085    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 555 aa  1141    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  73.25 
 
 		 561 aa  848    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  84.32 
 
 		 555 aa  996    Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 561 aa  549  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 562 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 560 aa  535  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 561 aa  522  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 557 aa  485  1e-135  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 634 aa  473  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 569 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 570 aa  430  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 570 aa  426  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 570 aa  425  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 564 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 574 aa  396  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 566 aa  367  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 588 aa  366  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 574 aa  346  6e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 590 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 582 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 579 aa  324  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 569 aa  288  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  29.48 
 
 		 720 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.220095 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51430  glutamate-trna ligase  30.18 
 
 		 523 aa  218  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 555 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 568 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 556 aa  203  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00070  glutamate-tRNA ligase, putative  30 
 
 		 728 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  34.53 
 
 		 749 aa  201  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 556 aa  200  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 799 aa  197  6e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 576 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 548 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 554 aa  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 556 aa  190  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 553 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 555 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 555 aa  190  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 556 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 557 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 556 aa  190  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 556 aa  190  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 555 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  28.88 
 
 		 858 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 590 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  27.98 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 554 aa  188  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 568 aa  187  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 556 aa  187  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 563 aa  186  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 		 554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  27.77 
 
 		 558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 561 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 582 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 555 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 580 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 		 556 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 570 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 556 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 		 557 aa  183  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 556 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 571 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 569 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 560 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 556 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 565 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 565 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 564 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 565 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>