84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1261 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1261  ribonucleotide reductase-related protein  100 
 
 		 978 aa  1959    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905113  hitchhiker  0.00163098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4237  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32 
 
 		 1258 aa  406  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  0.211473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1332  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.92 
 
 		 1258 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1151  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.59 
 
 		 1217 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210759  normal  0.34351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0933  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.1 
 
 		 1239 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0421297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1384  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.03 
 
 		 1205 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.034072  normal  0.508089 
 
 
-
 
NC_004310  BR1043  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.49 
 
 		 1264 aa  388  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1955  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.51 
 
 		 1236 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1008  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.49 
 
 		 1264 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2084  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.69 
 
 		 1263 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1571  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.17 
 
 		 1265 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3325  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.11 
 
 		 1257 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1785  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.9 
 
 		 1224 aa  386  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2131  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.94 
 
 		 1263 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2380  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.39 
 
 		 1262 aa  383  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2495  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.6 
 
 		 1218 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1162  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.9 
 
 		 1218 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.897146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2544  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  30.95 
 
 		 1257 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2912  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.11 
 
 		 1256 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824334  normal  0.16669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4674  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.36 
 
 		 1241 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411402  normal  0.22515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6038  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.17 
 
 		 1243 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.482275  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.48 
 
 		 1231 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2472  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.92 
 
 		 1236 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1413  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.93 
 
 		 1271 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114125  normal  0.496027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1589  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.81 
 
 		 1271 aa  366  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.872862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0295  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.83 
 
 		 1247 aa  365  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00235826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0303  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.32 
 
 		 1243 aa  364  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3299  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.28 
 
 		 1244 aa  364  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441324  normal  0.905318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1233  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.01 
 
 		 1263 aa  363  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.521746  normal  0.0561989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2599  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.85 
 
 		 1256 aa  362  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0184  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.55 
 
 		 1230 aa  361  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1231  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.58 
 
 		 1243 aa  353  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1102  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.3 
 
 		 1243 aa  352  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2560  ribonucleotide reductase-related protein  37.95 
 
 		 918 aa  351  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1037  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.2 
 
 		 1243 aa  350  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0800  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.41 
 
 		 1161 aa  291  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0716  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.57 
 
 		 1156 aa  286  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00503093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0539  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.81 
 
 		 1146 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.413657  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0577  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.53 
 
 		 1521 aa  265  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.288814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0876  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.21 
 
 		 1141 aa  263  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369071  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0703  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  33.53 
 
 		 1513 aa  258  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1782  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  32.31 
 
 		 1148 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.360896  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2540  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  37.36 
 
 		 1354 aa  157  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0169  hypothetical protein  57.76 
 
 		 508 aa  145  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27570  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  34.57 
 
 		 955 aa  145  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1476  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  33.81 
 
 		 1098 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1124  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  35.02 
 
 		 1004 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0740505  unclonable  0.0000199078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1431  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  34.72 
 
 		 948 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.154618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2425  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  35.18 
 
 		 938 aa  140  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1112  putative vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  53.28 
 
 		 543 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.464917  normal  0.666929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5426  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  32.87 
 
 		 963 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.675495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3976  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  33.58 
 
 		 988 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.629167  normal  0.0657242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7129  Ribonucleoside-diphosphate reductase  33.71 
 
 		 945 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17170  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  32.42 
 
 		 985 aa  135  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3507  ribonucleoside diphosphate reductase, B12-dependent  33.45 
 
 		 1281 aa  134  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.127912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3811  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  36.76 
 
 		 956 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2247  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  32.09 
 
 		 925 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.22308  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2335  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  29.44 
 
 		 928 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1613  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  31.72 
 
 		 925 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1411  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  34.35 
 
 		 962 aa  131  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560908  decreased coverage  0.00000497983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4560  ribonucleoside-diphosphate reductase adenosylcobalamin-dependent  33.6 
 
 		 946 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2198  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  33.58 
 
 		 929 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2149  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  32.95 
 
 		 934 aa  128  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3898  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  31.1 
 
 		 951 aa  127  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1025  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  31.25 
 
 		 1331 aa  125  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3326  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  30.13 
 
 		 1779 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1453  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  33.59 
 
 		 963 aa  121  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.745934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1235  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  30.52 
 
 		 1011 aa  121  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1817  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  31.72 
 
 		 994 aa  121  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0780054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1586  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.91 
 
 		 1370 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.945292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5520  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.99 
 
 		 963 aa  119  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3177  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  33.5 
 
 		 1032 aa  114  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2607  ribonucleotide reductase large subunit  38.26 
 
 		 177 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1804  ribonucleotide reductase large subunit  36.13 
 
 		 189 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1970  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.5 
 
 		 1180 aa  77.8  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.23883  decreased coverage  0.000751585 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0204  hypothetical protein  27.86 
 
 		 736 aa  63.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.116573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2594  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.27 
 
 		 730 aa  58.9  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.680732  normal  0.936152 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0022  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.83 
 
 		 741 aa  54.7  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2399  hypothetical protein  34.29 
 
 		 111 aa  48.9  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0018  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  24.35 
 
 		 781 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.132839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1269  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  23.71 
 
 		 1121 aa  44.7  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0309898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3073  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25 
 
 		 744 aa  44.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000012314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0259  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  23.04 
 
 		 728 aa  44.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.177918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2137  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.04 
 
 		 1042 aa  44.3  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>