40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0585 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  100 
 
 
221 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  30.37 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  38.41 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  38.25 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  34.52 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  30.91 
 
 
234 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  36.84 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  34.54 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  35.38 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  35.38 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  35.38 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  36.59 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  31.11 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  30.56 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  35.4 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3373  YhhN family protein  33.7 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257549  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  32.96 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  32.52 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  32.52 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  35.62 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  32.52 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  32.52 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  32.52 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  32.52 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  32.52 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  30.92 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  29.61 
 
 
220 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  33.33 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  30.61 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  31.65 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  28.16 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  28.16 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  33.57 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4354  YhhN family protein  31.96 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.856008  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  28.27 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  34.59 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  35.57 
 
 
626 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  29.55 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  34.67 
 
 
597 aa  41.6  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  34.67 
 
 
597 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>