106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0340 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  536  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.16 
 
 
283 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.42 
 
 
284 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.53 
 
 
283 aa  239  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.96 
 
 
287 aa  232  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.87 
 
 
288 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.79 
 
 
284 aa  229  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.8 
 
 
283 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.3 
 
 
281 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  45.35 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  43.63 
 
 
292 aa  222  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  43.31 
 
 
285 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.02 
 
 
285 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.62 
 
 
282 aa  216  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.76 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.38 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.25 
 
 
277 aa  209  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.68 
 
 
278 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.5 
 
 
293 aa  201  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.51 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.11 
 
 
276 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.41 
 
 
652 aa  191  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.84 
 
 
290 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  40.54 
 
 
280 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.78 
 
 
285 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.72 
 
 
285 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.55 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.4 
 
 
285 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.06 
 
 
288 aa  179  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.12 
 
 
289 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.51 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  39.39 
 
 
311 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.9 
 
 
351 aa  165  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.59 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.14 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.95 
 
 
267 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.07 
 
 
286 aa  123  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  28.83 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.23 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  33.64 
 
 
293 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  28.24 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.38 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
287 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.63 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.74 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.93 
 
 
286 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.91 
 
 
285 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.65 
 
 
286 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.9 
 
 
292 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.87 
 
 
282 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
289 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.32 
 
 
290 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.65 
 
 
306 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  31.87 
 
 
299 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.74 
 
 
291 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.39 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.09 
 
 
296 aa  98.6  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  32.89 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.72 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 
280 aa  95.9  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.76 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.2 
 
 
305 aa  89.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.78 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  29.2 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  37.97 
 
 
639 aa  53.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2423  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  44.07 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755414  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0870  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  36.71 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 
589 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 
461 aa  46.6  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.906646 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.46 
 
 
1105 aa  46.2  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1551  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.18 
 
 
289 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1973  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.72 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0247  hypothetical protein  27.38 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 
368 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1978  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  35.11 
 
 
314 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.996407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.81 
 
 
425 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1964  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  32.88 
 
 
766 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.82 
 
 
383 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.581713  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  35.11 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0679  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.05 
 
 
717 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  35.48 
 
 
379 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3575  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  35.82 
 
 
736 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.26 
 
 
305 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  24.46 
 
 
280 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.36 
 
 
986 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0800  hypothetical protein  42.86 
 
 
324 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0230  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 
1200 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0241  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 
1200 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  43.14 
 
 
629 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1376  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.37 
 
 
54 aa  42  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>