More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0182 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0182  aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia  100 
 
 
529 aa  1048    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1399  Xanthine/uracil/vitamin C permease  31.26 
 
 
450 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0106  Xanthine/uracil/vitamin C permease  31.45 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0864  xanthine/uracil permease-like protein  30.63 
 
 
566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3234  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.06 
 
 
577 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627871  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  27.58 
 
 
452 aa  156  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2628  xanthine/uracil/vitamin C permease  27 
 
 
598 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1798  Xanthine/uracil/vitamin C permease  26.22 
 
 
580 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426029 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  27.21 
 
 
451 aa  143  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1664  xanthine/uracil permease family protein  26.33 
 
 
580 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.139365  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  27.84 
 
 
452 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  27.84 
 
 
452 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  23.41 
 
 
500 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  23.48 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  26.55 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  24.67 
 
 
488 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0068  xanthine permease  25.84 
 
 
422 aa  125  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  28.07 
 
 
449 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  25.4 
 
 
445 aa  124  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  26.77 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  26.41 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  25.84 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  27.63 
 
 
434 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0466  Xanthine/uracil/vitamin C permease  24.56 
 
 
549 aa  121  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304923  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  25.34 
 
 
465 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  28.94 
 
 
825 aa  120  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  24.49 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  26.27 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  25.34 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  24.67 
 
 
462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  27.29 
 
 
487 aa  118  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  29.26 
 
 
413 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0447  uracil-xanthine permease  25.82 
 
 
422 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0436  uracil-xanthine permease  25.82 
 
 
422 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  27.07 
 
 
487 aa  116  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  26.41 
 
 
566 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  25.79 
 
 
442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  23.74 
 
 
458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  26.77 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  24.3 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  24.3 
 
 
462 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  24.71 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  27.9 
 
 
466 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  24.17 
 
 
463 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  24.54 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  24.22 
 
 
462 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  27.06 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  23.99 
 
 
462 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  23.99 
 
 
462 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  23.99 
 
 
462 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  24.48 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  24.48 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  24.48 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  24.48 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  24.48 
 
 
462 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  23.84 
 
 
462 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  26.32 
 
 
435 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  24.48 
 
 
462 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  23.2 
 
 
463 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  23.2 
 
 
463 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  23.2 
 
 
463 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  23.2 
 
 
463 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  23.2 
 
 
463 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  23.2 
 
 
463 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  23.2 
 
 
463 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  24.11 
 
 
459 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  24.16 
 
 
472 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  23.97 
 
 
459 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  24.16 
 
 
461 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  25 
 
 
479 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  23.2 
 
 
463 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1085  xanthine permease  25.23 
 
 
424 aa  108  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  23.87 
 
 
459 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  22.7 
 
 
463 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  22.7 
 
 
463 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  22.7 
 
 
463 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  22.7 
 
 
463 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  22.7 
 
 
463 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  25.51 
 
 
440 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  22.97 
 
 
463 aa  107  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  24.48 
 
 
446 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  23.82 
 
 
462 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  24.21 
 
 
459 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  23.73 
 
 
466 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  23.73 
 
 
466 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  23.73 
 
 
466 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  23.73 
 
 
466 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  23.73 
 
 
466 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  26.8 
 
 
478 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  23.94 
 
 
461 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  23.73 
 
 
466 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  25.15 
 
 
647 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  26.15 
 
 
493 aa  104  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  23.2 
 
 
464 aa  104  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  25.24 
 
 
440 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  25.24 
 
 
440 aa  104  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  26.47 
 
 
455 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  25.24 
 
 
440 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  26.47 
 
 
455 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  25.91 
 
 
633 aa  104  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>