76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0472 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0461  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.304933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0472  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249938  normal  0.535874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0448  hypothetical protein  99.6 
 
 
247 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5304  hypothetical protein  58.87 
 
 
258 aa  274  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1524  hypothetical protein  56.36 
 
 
249 aa  265  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0594  hypothetical protein  54.62 
 
 
240 aa  248  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  48.32 
 
 
239 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2887  Beta-lactamase-like protein  47.62 
 
 
248 aa  207  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3079  beta-lactamase domain protein  48.48 
 
 
248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2974  beta-lactamase-like protein  47.66 
 
 
252 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3489  hypothetical protein  46.38 
 
 
242 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969002  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  45.99 
 
 
243 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0281  hypothetical protein  48.3 
 
 
163 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0229241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 
397 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 
395 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 
395 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  28.17 
 
 
406 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
396 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5045  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521879  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.66 
 
 
575 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4522  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  28.17 
 
 
406 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  27 
 
 
582 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0086  hypothetical protein  23.26 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307031  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
407 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0538  Beta-lactamase-like  29.88 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  27.86 
 
 
576 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  27.98 
 
 
423 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  28.21 
 
 
407 aa  52.4  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.86 
 
 
576 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
576 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
407 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.3 
 
 
575 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.95 
 
 
574 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2557  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.583667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  26.95 
 
 
574 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.71 
 
 
575 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.71 
 
 
575 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 
425 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 
395 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  20.8 
 
 
575 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 
399 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  26.95 
 
 
571 aa  48.9  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 
400 aa  48.9  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  21.43 
 
 
396 aa  48.9  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  24.67 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 
387 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  23.21 
 
 
404 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  25.64 
 
 
407 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
576 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
407 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 
407 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  23.02 
 
 
414 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  25.48 
 
 
601 aa  45.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  24.04 
 
 
574 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  28.69 
 
 
884 aa  45.8  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  22.7 
 
 
579 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  22.31 
 
 
387 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.39 
 
 
573 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
407 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  27.19 
 
 
508 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  27.33 
 
 
569 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  21.99 
 
 
572 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  20.6 
 
 
396 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 
400 aa  43.5  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  22.22 
 
 
401 aa  43.5  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 
387 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  22.6 
 
 
392 aa  43.5  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0174  ATPase domain-containing protein  26.24 
 
 
394 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  27.73 
 
 
393 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 
402 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 
394 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  19.83 
 
 
387 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.35 
 
 
498 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.42 
 
 
407 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>