179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0450 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
407 aa  843    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  88.94 
 
 
407 aa  763    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  86.95 
 
 
406 aa  741    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0955  beta-lactamase domain-containing protein  78.96 
 
 
409 aa  667    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.86403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  93.12 
 
 
407 aa  795    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1554  beta-lactamase-like  64.2 
 
 
410 aa  554  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0457538  normal  0.358726 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  50.72 
 
 
407 aa  419  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1153  beta-lactamase domain-containing protein  51.95 
 
 
405 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  48.16 
 
 
404 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  42.22 
 
 
399 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  42.47 
 
 
403 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.45 
 
 
397 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  40.39 
 
 
397 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.84 
 
 
400 aa  291  2e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.52 
 
 
500 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 
392 aa  285  8e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  38.12 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.3 
 
 
479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  40.25 
 
 
387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.3 
 
 
479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.3 
 
 
479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  36.3 
 
 
479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.3 
 
 
479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.05 
 
 
479 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.05 
 
 
479 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.05 
 
 
479 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.3 
 
 
479 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  36.05 
 
 
479 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.05 
 
 
479 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.05 
 
 
479 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.05 
 
 
479 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  40.05 
 
 
387 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.07 
 
 
396 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  38.86 
 
 
404 aa  279  5e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.04 
 
 
493 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.63 
 
 
505 aa  278  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.8 
 
 
479 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  37.93 
 
 
405 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 
387 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  38.73 
 
 
402 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.56 
 
 
482 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.53 
 
 
498 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.76 
 
 
494 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  38.02 
 
 
395 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.05 
 
 
485 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  37.53 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.01 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.53 
 
 
499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 
405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  36.86 
 
 
418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.92 
 
 
504 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  37.16 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 
402 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.12 
 
 
396 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 
387 aa  260  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  38.48 
 
 
387 aa  259  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 
402 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  37.25 
 
 
404 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.79 
 
 
401 aa  258  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  37.78 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  34.88 
 
 
404 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  36.12 
 
 
396 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 
400 aa  243  6e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 
394 aa  239  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  34.65 
 
 
393 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 
402 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 
384 aa  209  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  34.06 
 
 
400 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.05 
 
 
394 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  33.73 
 
 
423 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
393 aa  196  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
396 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 
393 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  33.41 
 
 
397 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  32.02 
 
 
399 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  30.98 
 
 
395 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 
399 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 
392 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
396 aa  189  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0174  ATPase domain-containing protein  30.02 
 
 
394 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  29.88 
 
 
884 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 
394 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  30.49 
 
 
878 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  30.24 
 
 
878 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 
399 aa  176  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  29.2 
 
 
508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  30.24 
 
 
409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  30.47 
 
 
395 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  28.64 
 
 
431 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  34.67 
 
 
406 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  27.82 
 
 
388 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 
395 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  34.67 
 
 
406 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 
398 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>