More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1557 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 224 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174302  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1151  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.85 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1532  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.61 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000919754  unclonable  2.03359e-19 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.68 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.68 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2083  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.1 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0961871  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1365  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.32 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.62 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.44 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.68 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.68 
 
 		 213 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.12 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.49 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.18 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  36.49 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.49 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  33.16 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  35.82 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.5 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.53 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  35.32 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  34.18 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.18 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.12 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  32.65 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.75 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.81 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.75 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.15 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.35 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  32 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  33.33 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  33.33 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  33.33 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  33.33 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  33.33 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  33.33 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  34.34 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4773  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.27 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.75 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.32 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  33.17 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.88 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  32.66 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.66 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  32.99 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  33.17 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.81 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  33.17 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.97 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.68 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  34.65 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  34.67 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  30.92 
 
 		 203 aa  99  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  32.35 
 
 		 194 aa  99  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  34.67 
 
 		 197 aa  98.6  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  32.34 
 
 		 239 aa  98.2  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.18 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.63 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  32.08 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.15 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.85 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.63 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  32.08 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.08 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  32.08 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  33.5 
 
 		 197 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.28 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  30.54 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.02 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.71 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  33 
 
 		 197 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36 
 
 		 202 aa  95.5  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  31.82 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  30.96 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.9 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4013  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.71 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.648921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.58 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.1 
 
 		 231 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>