58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1548 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1548  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  179  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399307  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  42.86 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  48.65 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  43.21 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  46.38 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1412  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2852  protein of unknown function DUF1294  38.57 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000138701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  36.25 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1476  protein of unknown function DUF1294  46.15 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3043  protein of unknown function DUF1294  42.42 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816761  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0554  hypothetical protein  37.93 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000831877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0801  protein of unknown function DUF1294  37.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1740  hypothetical protein  36.76 
 
 
93 aa  50.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  31.17 
 
 
211 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  31.17 
 
 
209 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3263  hypothetical protein  36.59 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.446998  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1169  hypothetical protein  35.62 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  35.29 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  32.43 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  31.4 
 
 
225 aa  48.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  34.25 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3668  hypothetical protein  37.66 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  32.18 
 
 
238 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3575  hypothetical protein  37.66 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0517  hypothetical protein  34.18 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  30.85 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3268  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0756935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1649  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  33.33 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  32.14 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  33.72 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0531  hypothetical protein  36.84 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3354  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.175891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3585  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  34.57 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  30.56 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  31.71 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  28.05 
 
 
178 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3318  hypothetical protein  35.06 
 
 
82 aa  43.9  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3568  hypothetical protein  35.06 
 
 
82 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.641066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  30.86 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  28.24 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  28.57 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  28.41 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30 
 
 
219 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  28.4 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4942  protein of unknown function DUF1294  35.23 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  30.95 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  32.86 
 
 
144 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  34.43 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  34.33 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  34.43 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  34.43 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  28.57 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2479  protein of unknown function DUF1294  31.58 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.95 
 
 
223 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0699  protein of unknown function DUF1294  30.56 
 
 
102 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>