27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0428 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 153 aa  313  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0766  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.576445  normal  0.367206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  29.6 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1046  DNA polymerase, beta-like region  28.57 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.646258  normal  0.089906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1404  DNA polymerase, beta-like region  35.11 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304011  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  27.97 
 
 		 271 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  27.19 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  36.59 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  26.61 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  28.69 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  27.64 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0133  DNA polymerase, beta-like region  32.38 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  34.33 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  51.02 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  35.44 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  28.69 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  27.17 
 
 		 141 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 		 128 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 96 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  27.62 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  28.7 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  27.68 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  26.05 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>