33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2044 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  100 
 
 
335 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  49.56 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  51.44 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  46.54 
 
 
317 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  46.54 
 
 
317 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  36.86 
 
 
295 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  36.61 
 
 
250 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  36.45 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  30.54 
 
 
299 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  30.45 
 
 
313 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  30.04 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  44.79 
 
 
1821 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  25.23 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  40.4 
 
 
3322 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  44.04 
 
 
1079 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  27.15 
 
 
327 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  28.09 
 
 
225 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  29.55 
 
 
266 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  28.65 
 
 
228 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  29.45 
 
 
218 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  30.49 
 
 
226 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  31.11 
 
 
195 aa  53.1  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  39.13 
 
 
1144 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0029  FHA domain-containing protein  54.17 
 
 
470 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0854  hypothetical protein  41.35 
 
 
419 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0320102  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02743  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A (eIF3a)(Eukaryotic translation initiation factor 3 110 kDa subunit homolog)(eIF3 p110)(Translation initiation factor eIF3, p110 subunit homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9N7]  38.46 
 
 
1035 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.224701 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04719  conserved hypothetical protein similar to Rho guanine nucleotide exchange factor (Eurofung)  33.33 
 
 
1199 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  26.15 
 
 
218 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  34.29 
 
 
830 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2478  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  29.2 
 
 
653 aa  42.7  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304638  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  40 
 
 
1543 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01546  transcription factor (Sin3), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05570)  33.65 
 
 
1605 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>