44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4153 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  98.77 
 
 		 244 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  90.98 
 
 		 245 aa  400  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  75.21 
 
 		 246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  60.83 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  56.56 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  58.58 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  54.17 
 
 		 239 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  54.17 
 
 		 239 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  53.96 
 
 		 544 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  40.89 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  32.91 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  41.67 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  41.37 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  35.5 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  35.5 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  34.2 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  35.5 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  35.06 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  36.02 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  36.55 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  34.33 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  29.91 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  33.49 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  53.47 
 
 		 178 aa  98.6  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  34.72 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  25.2 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  42.86 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  27.61 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  31.08 
 
 		 484 aa  62  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  30.91 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  31.01 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  26.01 
 
 		 492 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  30 
 
 		 400 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  24.72 
 
 		 483 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  27.27 
 
 		 415 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  23.21 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  27.65 
 
 		 393 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  26.99 
 
 		 342 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  26.11 
 
 		 400 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  29.68 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  27.56 
 
 		 402 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  27.56 
 
 		 402 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  23.53 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>