More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3574 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  57.69 
 
 		 282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02447  phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit  31.22 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0850971  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  30.99 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  31.65 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  35.26 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 250 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.47 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 634 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.34 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  32.08 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  36.19 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  28 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  30.15 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.06 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  28.57 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2992  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.547914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  29.73 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  25.5 
 
 		 369 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0704  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 170 aa  52.8  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0858444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.36 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  34.62 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  25.14 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 285 aa  52.4  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 254 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  33 
 
 		 254 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  23.16 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 309 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  33 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 295 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.19 
 
 		 271 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 268 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.7 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.75 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.85 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.37 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 1106 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.7 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  27.35 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.19 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 355 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.7 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.89 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  28.57 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.71 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.92 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.89 
 
 		 345 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 810 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.7 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.6 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>