More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1060 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1060  formyl transferase domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1190  formyl transferase domain protein  99.65 
 
 		 288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0982  formyl transferase domain protein  88.89 
 
 		 288 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1761  formyl transferase domain protein  76.04 
 
 		 288 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5456  formyl transferase domain-containing protein  75.69 
 
 		 288 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0931925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5625  formyl transferase domain-containing protein  75.69 
 
 		 287 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.165091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5673  formyl transferase domain-containing protein  49.11 
 
 		 284 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5891  formyl transferase domain-containing protein  49.11 
 
 		 284 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487641  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  24.46 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00312  methionyl-tRNA formyltransferase  26.72 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0633  formyl transferase domain protein  31.31 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1644  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2249  formyl transferase domain protein  29.72 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  24.84 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  27.11 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  26.86 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  28.77 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  21.8 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  23.72 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  25.68 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  25.44 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  25.64 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  25.64 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  22.89 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  25.59 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  27.86 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  26.13 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  26.83 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  26.83 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  26.83 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  26.83 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  26.83 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  26.13 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  26.48 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  26.03 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  24.82 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  24.82 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  26.41 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  29.41 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  20.49 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  26.13 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  26.13 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  26.27 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  26.48 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  27.18 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  25.5 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  35.94 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  26.48 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  24.3 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0017  formyl transferase domain-containing protein  33.83 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  30.71 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  25.85 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  25.34 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  25.34 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  25.58 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  25.34 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  28.51 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  25.17 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  24.8 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  23.61 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  23.72 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  24.66 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  25.09 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4501  formyl transferase domain-containing protein  26.12 
 
 		 564 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  30.98 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  24.36 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  30.98 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  23.98 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  30.98 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  32.45 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  30.98 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  30.98 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  30.98 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  27.62 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  28.14 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4569  formyl transferase domain-containing protein  25.83 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  27.69 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  26.98 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  27.69 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  22.43 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  24.74 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  24.74 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  27.69 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  23.02 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  24.74 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  24.49 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  27.71 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  27.62 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  24.74 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  27.69 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  25.26 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  24.74 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  24.38 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  27.18 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  29.35 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  25.44 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  25.25 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  24.58 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>