55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3245 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3245  succinate dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 127 aa  255  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1831  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  61.6 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.405977  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1903  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  61.6 
 
 		 131 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2958  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  63.2 
 
 		 126 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3979  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  60 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705456  normal  0.476216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0952  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  59.2 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.676521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3691  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  60 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4136  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  57.6 
 
 		 126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1966  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  50 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4277  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  46.4 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.692368  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3601  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  47.2 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3893  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  47.2 
 
 		 139 aa  123  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7245  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  46.72 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396127  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0089  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  46.4 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6039  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  45.9 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1333  succinate dehydrogenase subunit D  40.32 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3617  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  45.16 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1434  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  49.19 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2750  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  40.32 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1745  succinate dehydrogenase subunit D  43.44 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2799  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  42.74 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1311  succinate dehydrogenase subunit D  40.98 
 
 		 129 aa  98.6  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0693068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0229  succinate dehydrogenase subunit D  42.28 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0481798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0458  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  48.39 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00603  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  41.27 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1549  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  42.86 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.591464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0217  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  37.9 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0326  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  37.4 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1536  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  43.31 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1203  succinate dehydrogenase subunit D  39.84 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.767553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2108  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  37.3 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0071  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  36.29 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0480  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  36.8 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.74591 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0045  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  38.58 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0379  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor subunit  37.8 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0343  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  37.01 
 
 		 127 aa  84.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3031  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  39.67 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0810  succinate dehydrogenase subunit D  35.83 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2847  succinate dehydrogenase subunit D  39.2 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1880  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  35.2 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519683  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2866  hypothetical protein  37.7 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4839  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  36 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5819  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  33.33 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3020  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  35.83 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3564  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  29.41 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0568  putative succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  34.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0825505 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5889  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  35.71 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3526  succinate dehydrogenase subunit D  32.41 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2635  putative succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  30.25 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0975  succinate dehydrogenase subunit D  30.25 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0087  hypothetical protein  30.25 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1222  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein, putative  26.74 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1141  succinate dehydrogenase cytochrome b556 small membrane subunit  26.67 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.470829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2472  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  34.33 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0917  putative succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  35.06 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>