24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2308 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 325 aa  681    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  30.55 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  28.62 
 
 		 346 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  28.48 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  30.55 
 
 		 358 aa  152  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.28 
 
 		 364 aa  145  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.99 
 
 		 366 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.98 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  27.3 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.5 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  27.3 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  21.39 
 
 		 442 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>