53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1476 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1397    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1837  hypothetical protein  32.23 
 
 		 697 aa  340  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2019  protein of unknown function DUF87  30.97 
 
 		 700 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4804  hypothetical protein  31.68 
 
 		 670 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0408  hypothetical protein  29.15 
 
 		 657 aa  267  5e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.54792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3942  hypothetical protein  27.52 
 
 		 721 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.222103  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1619  hypothetical protein  26.76 
 
 		 721 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7314  hypothetical protein  26.29 
 
 		 699 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00058158  hitchhiker  0.000000228931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  26.04 
 
 		 708 aa  64.3  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  28.77 
 
 		 659 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  28.78 
 
 		 670 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  21.12 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  25 
 
 		 250 aa  55.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  29.38 
 
 		 496 aa  54.7  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  31.9 
 
 		 607 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  26.98 
 
 		 544 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  25 
 
 		 581 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  27.2 
 
 		 569 aa  50.8  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0691  hypothetical protein  23.9 
 
 		 700 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00451625  hitchhiker  0.000217463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  28.35 
 
 		 569 aa  50.8  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  31.45 
 
 		 587 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  34.25 
 
 		 577 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0715  HerA helicase  30.77 
 
 		 409 aa  49.7  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  24.73 
 
 		 499 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  23.02 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.49 
 
 		 605 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  22.58 
 
 		 557 aa  48.5  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  34.25 
 
 		 579 aa  48.5  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  33.93 
 
 		 601 aa  48.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  30.28 
 
 		 570 aa  48.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  29.36 
 
 		 674 aa  47.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  29.41 
 
 		 709 aa  47.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  26.76 
 
 		 693 aa  47.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  31.3 
 
 		 664 aa  47.4  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  32.97 
 
 		 360 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  28.1 
 
 		 546 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  26.49 
 
 		 651 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  32.39 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  32.91 
 
 		 550 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  32.88 
 
 		 714 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  23.41 
 
 		 608 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25 
 
 		 496 aa  46.2  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  34.83 
 
 		 493 aa  45.4  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  28.47 
 
 		 603 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  23.48 
 
 		 616 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  22.99 
 
 		 546 aa  45.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  25.98 
 
 		 674 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  33.71 
 
 		 497 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  32.58 
 
 		 497 aa  44.3  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  32.58 
 
 		 497 aa  44.3  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  28.12 
 
 		 579 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1614  hypothetical protein  27.88 
 
 		 519 aa  43.9  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  28.3 
 
 		 679 aa  43.9  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>