30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4579 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  100 
 
 		 448 aa  886    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  31.14 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  31.76 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  30.23 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  30.56 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  26.51 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  24.29 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  26.45 
 
 		 429 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  26.39 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  29.08 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  30.05 
 
 		 453 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  33.72 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  28 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  29.5 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  27 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  31.01 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  32.1 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  32.1 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  30.39 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  30.95 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  29.47 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  26.29 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  34.72 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  36.71 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  27.19 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  30.71 
 
 		 735 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  27.46 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>