44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4521 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  98.77 
 
 		 243 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  91.8 
 
 		 245 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  75.21 
 
 		 246 aa  332  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  61.25 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  56.97 
 
 		 245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  59 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  54.17 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  53.33 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  52.97 
 
 		 544 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  41.3 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  32.91 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  41.67 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  35.93 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  42 
 
 		 248 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  34.2 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  35.06 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  35.06 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  35.06 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  36.86 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  37.82 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  35.62 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  30.77 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  33.49 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  53.47 
 
 		 178 aa  99  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  28.3 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  26.8 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  42.86 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  26.59 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  31.08 
 
 		 484 aa  62  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  31.55 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  31.01 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  30 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  26.11 
 
 		 492 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  25.61 
 
 		 483 aa  52.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  28.26 
 
 		 415 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  28.3 
 
 		 393 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  26.22 
 
 		 342 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  26.51 
 
 		 400 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  29.22 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  26.92 
 
 		 402 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  26.92 
 
 		 402 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  23.53 
 
 		 439 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>