280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1158 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1031  Glycerone kinase  96.88 
 
 
545 aa  871    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593318  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2889  Glycerone kinase  73.3 
 
 
542 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0963  Glycerone kinase  89.17 
 
 
545 aa  833    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459045  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1158  Glycerone kinase  100 
 
 
545 aa  1027    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263533  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0893  Glycerone kinase  55.74 
 
 
546 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2726  Glycerone kinase  53.42 
 
 
556 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4584  Glycerone kinase  49.08 
 
 
539 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150824  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2432  Glycerone kinase  55.26 
 
 
547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739383  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  49.63 
 
 
548 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2167  Glycerone kinase  54.29 
 
 
544 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3559  Glycerone kinase  60.29 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.463491  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2326  Glycerone kinase  45.04 
 
 
562 aa  359  6e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  44.5 
 
 
567 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  40.48 
 
 
580 aa  327  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  37.41 
 
 
577 aa  323  4e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  44.6 
 
 
567 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  42.91 
 
 
567 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  42.81 
 
 
566 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  43.46 
 
 
566 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  42.41 
 
 
569 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  42.41 
 
 
569 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  42.88 
 
 
572 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  44.33 
 
 
570 aa  273  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  44.33 
 
 
570 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  44.39 
 
 
616 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  44.79 
 
 
616 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  44.39 
 
 
570 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  32.26 
 
 
582 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04180  dihydroxyacetone kinase 1, putative  36.27 
 
 
591 aa  264  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  33.93 
 
 
583 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  33.93 
 
 
583 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  34.39 
 
 
583 aa  256  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  33.77 
 
 
583 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  34.1 
 
 
583 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  33.93 
 
 
583 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  34.53 
 
 
583 aa  251  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  33.77 
 
 
583 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08050  glycerone kinase, putative  33.5 
 
 
600 aa  249  8e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  34.1 
 
 
583 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  33.61 
 
 
583 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  34.67 
 
 
583 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  38.27 
 
 
546 aa  243  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57462  dihydroxyacetone kinase  31.91 
 
 
595 aa  229  8e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0972297  normal  0.404993 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.43 
 
 
329 aa  229  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.18 
 
 
332 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.38 
 
 
332 aa  218  2e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  40.04 
 
 
560 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.24 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  35.74 
 
 
587 aa  216  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  36.56 
 
 
616 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.4 
 
 
329 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.14 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  33.09 
 
 
544 aa  209  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  36.09 
 
 
581 aa  206  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.56 
 
 
332 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.25 
 
 
320 aa  205  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  38.97 
 
 
573 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.19 
 
 
322 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.19 
 
 
322 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00034  dihydroxyacetone kinase (Eurofung)  32.5 
 
 
590 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.160552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  34.12 
 
 
598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  35.91 
 
 
581 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  35.91 
 
 
581 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.63 
 
 
332 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.38 
 
 
333 aa  200  5e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31117  dihydroxyacetone kinase isoenzyme I  29.1 
 
 
597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  35.86 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.37 
 
 
332 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  36 
 
 
569 aa  196  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.44 
 
 
332 aa  195  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.14 
 
 
330 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  40.06 
 
 
332 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.96 
 
 
331 aa  194  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  35.92 
 
 
568 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  41.47 
 
 
335 aa  193  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.25 
 
 
333 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  32.57 
 
 
612 aa  193  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3953  dihydroxyacetone kinase  36.33 
 
 
587 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.75 
 
 
333 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.98 
 
 
332 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.18 
 
 
333 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.03 
 
 
333 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.97 
 
 
333 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.85 
 
 
331 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1132  DhaKLM operon coactivator DhaQ  34.32 
 
 
332 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.51 
 
 
330 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2647  dihydroxyacetone kinase  37.6 
 
 
567 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.88 
 
 
331 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  37.73 
 
 
333 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.1 
 
 
354 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.34 
 
 
354 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  36.07 
 
 
571 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.81 
 
 
364 aa  184  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  33.87 
 
 
544 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  33.87 
 
 
544 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.07 
 
 
333 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  33.87 
 
 
544 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.06 
 
 
333 aa  183  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  44.08 
 
 
330 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0873  DhaKLM operon coactivator DhaQ  34.47 
 
 
332 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>